Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn3Q9Z0G9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn3Q9Z0G9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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