Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx1Q9WV80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Snx1Q9WV80 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx1Q9WV80 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx1Q9WV80 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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