Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Npas3Q9QZQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Npas3Q9QZQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms