Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ripk3Q9QZL0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk3Q9QZL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ripk3Q9QZL0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ripk3Q9QZL0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms