Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm40Q9QYA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tomm40Q9QYA2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tomm40Q9QYA2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms