Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn4Q9QXZ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn4Q9QXZ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Opn4Q9QXZ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms