Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga2bQ9QUM0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga2bQ9QUM0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga2bQ9QUM0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga2bQ9QUM0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms