Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pkd2l2Q9JLG4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms