Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms