Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tuba8Q9JJZ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tuba8Q9JJZ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tuba8Q9JJZ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms