Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alyref2Q9JJW6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Alyref2Q9JJW6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alyref2Q9JJW6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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