Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ascl3Q9JJR7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl3Q9JJR7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl3Q9JJR7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms