Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms