Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FliiQ9JJ28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FliiQ9JJ28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FliiQ9JJ28 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms