Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbr1Q9JIT0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbr1Q9JIT0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms