Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1fQ9JIS7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1fQ9JIS7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1fQ9JIS7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms