Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup50Q9JIH2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms