Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pus3Q9JI38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pus3Q9JI38 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pus3Q9JI38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms