Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf3Q9ET30 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf3Q9ET30 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tm9sf3Q9ET30 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tm9sf3Q9ET30 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tm9sf3Q9ET30 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tm9sf3Q9ET30 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms