Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ropn1Q9ESG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ropn1Q9ESG2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ropn1Q9ESG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms