Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhojQ9ER71 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RhojQ9ER71 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhojQ9ER71 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms