Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf23Q9ER63 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tnfrsf23Q9ER63 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms