Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rp2Q9EPK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rp2Q9EPK2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rp2Q9EPK2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rp2Q9EPK2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms