Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tsc1Q9EP53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tsc1Q9EP53 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tsc1Q9EP53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Tsc1Q9EP53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Tsc1Q9EP53 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Tsc1Q9EP53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Tsc1Q9EP53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Tsc1Q9EP53 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Tsc1Q9EP53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tsc1Q9EP53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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