Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap3s1Q9DCR2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ap3s1Q9DCR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ap3s1Q9DCR2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms