Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb6Q9DC29 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb6Q9DC29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb6Q9DC29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms