Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5aQ9D9D5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmco5aQ9D9D5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmco5aQ9D9D5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.9 ms