Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec11cQ9D8V7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec11cQ9D8V7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec11cQ9D8V7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms