Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Derl3Q9D8K3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl3Q9D8K3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl3Q9D8K3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms