Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn22Q9D7U6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn22Q9D7U6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn22Q9D7U6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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