Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp5Q9D7S9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp5Q9D7S9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms