Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tube1Q9D6T1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tube1Q9D6T1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms