Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calml3Q9D6P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Calml3Q9D6P8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Calml3Q9D6P8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms