Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb8Q9D6J5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufb8Q9D6J5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufb8Q9D6J5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms