Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdr42e1Q9D665 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr42e1Q9D665 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr42e1Q9D665 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms