Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip1Q9D620 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip1Q9D620 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip1Q9D620 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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