Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zc2hc1bQ9D534 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zc2hc1bQ9D534 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms