Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Obox1Q9D350 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Obox1Q9D350 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Obox1Q9D350 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Obox1Q9D350 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms