Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec13Q9D1M0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec13Q9D1M0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sec13Q9D1M0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms