Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp1Q9CYR0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssbp1Q9CYR0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp1Q9CYR0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms