Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis12Q9CY25 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mis12Q9CY25 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mis12Q9CY25 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mis12Q9CY25 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mis12Q9CY25 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mis12Q9CY25 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms