Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PmpcbQ9CXT8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PmpcbQ9CXT8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PmpcbQ9CXT8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.2 ms