Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm8aQ9CWZ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm8aQ9CWZ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm8aQ9CWZ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms