Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atxn3Q9CVD2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atxn3Q9CVD2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn3Q9CVD2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms