Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sppl3Q9CUS9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sppl3Q9CUS9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sppl3Q9CUS9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms