Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska2Q9CR46 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ska2Q9CR46 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ska2Q9CR46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms