Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifitm3Q9CQW9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifitm3Q9CQW9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms