Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer1Q9CQL2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccer1Q9CQL2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccer1Q9CQL2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms