Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nipsnap3bQ9CQE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nipsnap3bQ9CQE1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms