Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab5aQ9CQD1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab5aQ9CQD1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab5aQ9CQD1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms